Εξαιτίας του ιδιαίτερου μικροκλίματος, έχει αναπτυχθεί ένα
μοναδικό οικοσύστημα. Χαρακτηρίστηκε ως Υγρότοπος Ραμσάρ διεθνούς σημασίας στις 18 Μαΐου 1999. Μαζί με το υπόγειο ρεύμα του ποταμού Ρέκα, αποτελεί έναν από τους μεγαλύτερους καρστικούς υπόγειους υγροτόπους στην Ευρώπη.
Το μεγάλο μέγεθος του υπόγειου φαραγγιού είναι αυτό που ξεχωρίζει τα σπήλαια Σκότσγιαν από άλλα παρόμοια υπόγεια χαρακτηριστικά στο κόσμο. Έχει μήκος 3,5 χιλιόμετρα, πλάτος 10 με 60 μέτρα και ύψος πάνω από 140 μέτρα. Σε κάποια σημεία σχηματίζει μεγάλους θαλάμους.
Ο μεγαλύτερος από αυτούς είναι ο θάλαμος του Μάρτελ, με όγκο 2,2 εκατομμύρια κυβικά μέτρα, και είναι ο μεγαλύτερος υπόγειος θάλαμος στην Ευρώπη. Ο θάλαμος καταλήγει σε ένα μικρό πέρασμα, το οποίο δεν μπορεί να διοχετεύσει σε περίπτωση ισχυρών βροχοπτώσεων το νερό, με αποτέλεσμα την άνοδο του επιπέδου του νερού για πάνω από εκατό μέτρα.
Η Big Collapse Doline, η μεγάλη δολίνη και η Little Collapse Doline, η μικρή δολίνη, βρίσκονται στο κάτω μέρος του σπηλαίου, εκεί όπου βρίσκονται και οι είσοδοί του. Στην Big Collapse Doline, ο ποταμός Reka εξαφανίζεται υπόγεια στα σπήλαια Škocjan και στη συνέχεια ρέει υπόγεια για 34 χιλιόμετρα, αναδυόμενος στην επιφάνεια κοντά στο Monfalcone. Εκεί, συμβάλλει περίπου το ένα τρίτο της ροής του ποταμού Timavo, ο οποίος διανύει 2 χιλιόμετρα από τις πηγές Timavo στην Αδριατική Θάλασσα.
Το εξερευνημένο μήκος των σπηλαίων είναι 6.200 μέτρα. Τα σπήλαια σχηματίστηκαν σε ένα πάχους 300 μέτρων στρώμα ασβεστόλιθου. Η περιοχή κατοικείται από την προϊστορία.


.jpg)




.jpg)





.jpg)